Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9DA42 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9DA42 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9DA42 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9DA42 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9DA42 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9DA42 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9DA42 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9DA42 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9DA42 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9DA42 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9DA42 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9DA42 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9DA42 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9DA42 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9DA42 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9DA42 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9DA42 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9DA42 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9DA42 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9DA42 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9DA42 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9DA42 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9DA42 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9DA42 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9DA42 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9DA42 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9DA42 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9DA42 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9DA42 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9DA42 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9DA42 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9DA42 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9DA42 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9DA42 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9DA42 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9DA42 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9DA42 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9DA42 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9DA42 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9DA42 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9DA42 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9DA42 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9DA42 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9DA42 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9DA42 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9DA42 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9DA42 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9DA42 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9DA42 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9DA42 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9DA42 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9DA42 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9DA42 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9DA42 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9DA42 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9DA42 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9DA42 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9DA42 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9DA42 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9DA42 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9DA42 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9DA42 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9DA42 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9DA42 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9DA42 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9DA42 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9DA42 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9DA42 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9DA42 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9DA42 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9DA42 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9DA42 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9DA42 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9DA42 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9DA42 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9DA42 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9DA42 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9DA42 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9DA42 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9DA42 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9DA42 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q9DA42 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9DA42 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9DA42 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9DA42 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9DA42 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9DA42 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9DA42 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9DA42 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9DA42 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9DA42 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9DA42 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9DA42 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms