Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2e2Q9D902 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e2Q9D902 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf2e2Q9D902 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms