Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Alkbh4Q9D8F1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Alkbh4Q9D8F1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Alkbh4Q9D8F1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms