Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl4Q9D8E6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl4Q9D8E6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl4Q9D8E6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpl4Q9D8E6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpl4Q9D8E6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms