Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slx4ipQ9D7Y9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx4ipQ9D7Y9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slx4ipQ9D7Y9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms