Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Polr2dQ9D7M8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Polr2dQ9D7M8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Polr2dQ9D7M8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Polr2dQ9D7M8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms