Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp19Q9D7A6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp19Q9D7A6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp19Q9D7A6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp19Q9D7A6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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