Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klhl40Q9D783 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klhl40Q9D783 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl40Q9D783 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms