Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop56Q9D6Z1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nop56Q9D6Z1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nop56Q9D6Z1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop56Q9D6Z1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms