Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt34Q9D646 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt34Q9D646 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt34Q9D646 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms