Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata1Q9D5R4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata1Q9D5R4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata1Q9D5R4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spata1Q9D5R4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spata1Q9D5R4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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