Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zc2hc1bQ9D534 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zc2hc1bQ9D534 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms