Protein–RNA interactions for Protein: Q9D519

4930524N10Rik, RIKEN cDNA 4930524N10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524N10RikQ9D519 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930524N10RikQ9D519 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930524N10RikQ9D519 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930524N10RikQ9D519 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930524N10RikQ9D519 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930524N10RikQ9D519 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930524N10RikQ9D519 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930524N10RikQ9D519 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930524N10RikQ9D519 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930524N10RikQ9D519 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930524N10RikQ9D519 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930524N10RikQ9D519 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms