Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D4W2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D4W2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D4W2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D4W2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D4W2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D4W2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D4W2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D4W2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D4W2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D4W2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D4W2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D4W2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D4W2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9D4W2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D4W2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D4W2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D4W2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms