Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lonrf3Q9D4H7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lonrf3Q9D4H7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lonrf3Q9D4H7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms