Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ss18l2Q9D174 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18l2Q9D174 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ss18l2Q9D174 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1150.8 ms