Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hddc3Q9D114 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hddc3Q9D114 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hddc3Q9D114 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hddc3Q9D114 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms