Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem88Q9D0N8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem88Q9D0N8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem88Q9D0N8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem88Q9D0N8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms