Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acsl3Q9CZW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acsl3Q9CZW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acsl3Q9CZW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Acsl3Q9CZW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acsl3Q9CZW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acsl3Q9CZW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acsl3Q9CZW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acsl3Q9CZW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acsl3Q9CZW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acsl3Q9CZW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acsl3Q9CZW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acsl3Q9CZW4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms