Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CenpnQ9CZW2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpnQ9CZW2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CenpnQ9CZW2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpnQ9CZW2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpnQ9CZW2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpnQ9CZW2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpnQ9CZW2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms