Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nde1Q9CZA6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nde1Q9CZA6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nde1Q9CZA6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nde1Q9CZA6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nde1Q9CZA6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nde1Q9CZA6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nde1Q9CZA6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nde1Q9CZA6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nde1Q9CZA6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms