Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp2Q9CYZ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp2Q9CYZ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp2Q9CYZ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms