Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gins3Q9CY94 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gins3Q9CY94 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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