Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXX9

Cuedc2, CUE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cuedc2Q9CXX9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cuedc2Q9CXX9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cuedc2Q9CXX9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cuedc2Q9CXX9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cuedc2Q9CXX9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cuedc2Q9CXX9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms