Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmed5Q9CXE7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmed5Q9CXE7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms