Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smyd3Q9CWR2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smyd3Q9CWR2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smyd3Q9CWR2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smyd3Q9CWR2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smyd3Q9CWR2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms