Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc43Q9CR29 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc43Q9CR29 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc43Q9CR29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc43Q9CR29 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms