Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg12Q9CQY1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg12Q9CQY1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg12Q9CQY1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg12Q9CQY1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms