Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim8Q9CQQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim8Q9CQQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms