Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rwdd1Q9CQK7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rwdd1Q9CQK7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rwdd1Q9CQK7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rwdd1Q9CQK7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rwdd1Q9CQK7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms