Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc18Q9CQ07 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc18Q9CQ07 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc18Q9CQ07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lrrc18Q9CQ07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms