Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nsmce3Q9CPR8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nsmce3Q9CPR8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms