Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prpf8Q99PV0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prpf8Q99PV0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf8Q99PV0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf8Q99PV0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332.9 ms