Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2ird2Q99NI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2ird2Q99NI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms