Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vgll1Q99NC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vgll1Q99NC0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vgll1Q99NC0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll1Q99NC0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1798.1 ms