Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b1Q99NB9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b1Q99NB9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sf3b1Q99NB9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms