Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Atp1b4Q99ME6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Atp1b4Q99ME6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atp1b4Q99ME6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Atp1b4Q99ME6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atp1b4Q99ME6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Atp1b4Q99ME6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms