Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cmtm3Q99LJ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cmtm3Q99LJ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm3Q99LJ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm3Q99LJ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms