Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clp1Q99LI9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clp1Q99LI9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clp1Q99LI9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clp1Q99LI9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clp1Q99LI9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms