Protein–RNA interactions for Protein: Q99L90

Mcrs1, Microspherule protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrs1Q99L90 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mcrs1Q99L90 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mcrs1Q99L90 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mcrs1Q99L90 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mcrs1Q99L90 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms