Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsl24d1Q99L28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsl24d1Q99L28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsl24d1Q99L28 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsl24d1Q99L28 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms