Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TriobpQ99KW3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TriobpQ99KW3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TriobpQ99KW3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TriobpQ99KW3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TriobpQ99KW3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TriobpQ99KW3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms