Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Def8Q99J78 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Def8Q99J78 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Def8Q99J78 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Def8Q99J78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179 ms