Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spdl1Q923A2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spdl1Q923A2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spdl1Q923A2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms