Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn1Q922Y1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ubxn1Q922Y1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn1Q922Y1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms