Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc1Q91Z38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc1Q91Z38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc1Q91Z38 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc1Q91Z38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms