Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y20

Pcdha10, Protocadherin alpha-10, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha10Q91Y20 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha10Q91Y20 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha10Q91Y20 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha10Q91Y20 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha10Q91Y20 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha10Q91Y20 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha10Q91Y20 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdha10Q91Y20 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha10Q91Y20 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha10Q91Y20 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms