Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Creb3l3Q91XE9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Creb3l3Q91XE9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Creb3l3Q91XE9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Creb3l3Q91XE9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Creb3l3Q91XE9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb3l3Q91XE9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Creb3l3Q91XE9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb3l3Q91XE9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms