Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Chrna2Q91X60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chrna2Q91X60 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chrna2Q91X60 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chrna2Q91X60 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chrna2Q91X60 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms