Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q91WD4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q91WD4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q91WD4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q91WD4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q91WD4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q91WD4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q91WD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q91WD4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q91WD4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q91WD4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q91WD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q91WD4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q91WD4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Q91WD4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q91WD4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q91WD4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q91WD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q91WD4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q91WD4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q91WD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q91WD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q91WD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q91WD4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q91WD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q91WD4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q91WD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q91WD4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q91WD4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q91WD4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q91WD4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q91WD4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q91WD4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q91WD4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q91WD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q91WD4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q91WD4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q91WD4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q91WD4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q91WD4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q91WD4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q91WD4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q91WD4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q91WD4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q91WD4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q91WD4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q91WD4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q91WD4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q91WD4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Q91WD4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q91WD4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q91WD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q91WD4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q91WD4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q91WD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q91WD4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q91WD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q91WD4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q91WD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q91WD4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q91WD4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q91WD4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q91WD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q91WD4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q91WD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q91WD4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q91WD4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q91WD4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q91WD4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q91WD4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q91WD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q91WD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q91WD4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q91WD4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q91WD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q91WD4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q91WD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q91WD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q91WD4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q91WD4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q91WD4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Q91WD4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q91WD4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q91WD4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q91WD4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q91WD4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q91WD4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q91WD4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q91WD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q91WD4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q91WD4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q91WD4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms